Jakmile se virus dostane na sliznici nosní dutiny, začíná proces, který se během několika hodin až dnů projeví typickými příznaky nachlazení.
Rinoviry se nejprve navážou na receptory na povrchu buněk nosního epitelu. U velké části rinovirů je významným receptorem například ICAM-1. Po vstupu do buňky virus využívá její buněčný aparát ke své replikaci a vytváření dalších virových částic. Infikované buňky současně velmi rychle rozpoznávají přítomnost viru a spouštějí obrannou reakci.
Právě tato reakce je zásadní pro vznik příznaků. Infikované buňky začínají produkovat signální molekuly a zánětlivé mediátory, které aktivují další složky imunitního systému. Do procesu vstupují například cytokiny a chemokiny, které přitahují do místa infekce imunitní buňky.
Výsledkem je rozšíření cév v nosní sliznici a její překrvení. Zvětšuje se objem nosních skořep a průchod nosní dutinou se zužuje. Člověk tento proces vnímá jako typický pocit ucpaného nosu.
Současně se zvyšuje propustnost drobných cév a část tekutiny proniká do okolní tkáně. Vzniká otok sliznice a vodnatá sekrece, která je charakteristická především pro počáteční fázi rýmy. Pohárkové buňky a žlázy nosní sliznice navíc zvyšují tvorbu hlenu, jehož úkolem je zachycovat cizorodé částice a pomáhat je z dýchacích cest odstranit.
Důležitou roli za normálních okolností hrají také drobné řasinky neboli cilie na povrchu epitelu. Ty koordinovaným pohybem transportují hlen směrem do nosohltanu. Během infekce může být jejich funkce dočasně narušena, což přispívá k hromadění hlenu a pocitu zahlenění.